Quando a ameaça dos Anjos aumenta, a força de defesa da humanidade é levada ao limite, com a NERV na linha da frente da luta. Shinji Ikari e a sua parceira Rei Ayanami são auxiliados por dois novos pilotos: a impetuosa Asuka Langley Shikinami e a misteriosa Mari Illustrious Makinami. Com a ajuda das suas unidades mecanizadas Evangelion, equipadas com armas perfeitas para enfrentar os seus monstruosos adversários, as quatro jovens almas lutam desesperadamente para proteger os seus entes queridos e impedir um apocalipse iminente. Mas quando segredos assustadores são revelados, será que o maior desafio dos heróis serão os monstros... ou a própria humanidade?
